此外，由于不同群体的政治优先事项和利益存在差异，顶级候选人制度在 年竞选期间也面临议会中的某种反对，而且考虑到国家政党对这一问题的影响，不排除民粹主义和欧洲怀疑论政党（如 ）可能再次反对该制度。举个例子：在上次选举之前， % 的欧洲议会议员反对适用首席候选人程序，因为他们所在的欧洲议会党派没有任命任何候选人；其中 %体现了其本国政党的意愿，不再授权欧盟的治理和机构。
这种分歧在议会 年就选举法可能的改 华人海外数据 革进行投票时表达的立场上表现得更加明显，其直接目的是加强首席候选人制度。 的一些统计数据显示，这一程序仅得到议会中两个主要党派——欧洲人民党（ ）和社会民主党（ & ）的支持，这也要归功于盖伊·维尔霍夫斯塔德（ ）的 集团所发挥的关键作用，该集团获得了 票赞成，其中大部分来自两个历史悠久的欧洲政党。
但最大的问题是欧洲议会和欧洲理事会之间机构间关系的变化。 化引发了人们对欧盟委员会高级机构人物可能充当议会代理人的担忧。穆勒·戈麦斯和韦塞尔斯（ ）强调让-克洛德·容克的行为是欧盟首席候选人实验的“ 号病人”：首先，他的委员会采取的内部改革通过赋予副主席权力，开启了欧盟体系中一个非官僚机构的政治化进程。