运行工作流所需的扩展

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asimj1
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运行工作流所需的扩展

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图 :网络视图显示所选化合物以及包含“具有角色”和“是”等 subClassOf 连接的网络。
步骤 择两个不同的作用,例如已知的 多巴胺能拮抗剂 与 H1受体拮抗剂 起到缓解过敏反应的作用。

在最后一个组件“查看共享所选角色的化合物”(步骤 5)中,我们可以看到所有包含所选角色和附加信息的化合物,例如定义、同义词或对其他本体、数据库和来源的引用。


图 工作流的最后一个交互式视图,显示了具 开曼群岛电话号码数据 有附加信息的化合物,它们均从网络视图中选择了“角色”。
语义网/链接数据。要了解有关该扩展的更多信息,您可以找到这篇博客文章 集成更多数据源:语义网 也很有趣。
RDKit KNIME 集成 用于执行子结构搜索和突出显示
网络挖矿扩展 用于创建网络视图
有关如何安装扩展的说明,请参见 这里。


我们从包含 ChEBI 本体的 OWL 文件开始,并经历了数据探索和可视化的不同步骤。我们展示了如何读取 OWL 文件、如何在 SPARQL 中创建查询,并展示了在交互式复合视图中可视化本体内容的不同可能性。通过此,我们了解了 Promazine 化合物及其生物和化学作用。我们还发现了更多有关类似化合物及其作用、定义和同义词的信息。

可以使用我们的分析平台直接探索从 ChEBI 本体中提取的结果数据。该工作流还可以部署到 服务器 某个研究领域的专家可能不是本体论专家,但他可以分析 网络门户 无需编写 SPARQL 查询。
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